定量蛋白质组学（Quantitative Proteomics）研究蛋白质表达水平及其动态变化，广泛应用于生命科学、医学研究和生物制药等领域。通过对生物系统（如细胞、组织、体液或生物体）的蛋白质进行系统定量分析，研究人员可以解析蛋白质在不同条件下的变化，从而揭示生物学机制、疾病发生发展及药物作用的潜在机制。定量蛋白质组学主要通过高通量质谱技术结合多种标记或无标记策略，实现蛋白质丰度的相对或绝对定量。相较于传统的蛋白质分析方法，如Western blot或ELISA，定量蛋白质组学具备高通量、灵敏度高、覆盖范围广等优势，可一次性解析上千种蛋白质的表达水平及翻译后修饰状态。

一、定量蛋白质组学策略

定量蛋白质组学通常采用两种主要策略：标记定量和无标记定量。

1、标记定量（Label-based Quantification）标记定量策略通过在样品中引入稳定同位素标记，以区分不同条件下的蛋白质，从而实现高精度的定量分析。常见的方法包括：

（1）体内代谢标记

• SILAC：通过培养基中的重标氨基酸（如¹³C₆-Arg）标记活细胞蛋白质，适用于细胞模型动态追踪。
• ¹⁵N代谢标记：利用¹⁵N同位素标记模式生物（如酵母、植物），实现全蛋白质组标记。

（2）体外化学标记

• iTRAQ/TMT：通过化学标签标记肽段，在质谱检测前进行样本混合，实现多重样本定量。

这些方法通过在样品前处理阶段进行化学或代谢标记，提高数据的准确性和重复性，适用于比较不同样本之间的蛋白质表达差异。

2、无标记定量（Label-free Quantification, LFQ）无标记定量依赖于质谱信号强度或肽段检测频率进行蛋白质相对定量，主要包括：

（1）基于峰面积（Intensity-based）：通过提取离子流色谱图（XIC）积分定量，适合高丰度蛋白。

（2）基于谱计数（Spectral Counting）：统计肽段匹配谱图数，对低丰度蛋白更敏感。

无标记方法避免了标记过程的额外成本和时间消耗，且适用于大规模样本分析，但其定量精度可能受质谱仪稳定性及实验条件影响。

二、定量蛋白质组学的优势

1、高通量分析能力

现代质谱技术可一次性检测数千种蛋白质，为系统生物学研究提供全面的蛋白质表达谱。

2、高灵敏度和特异性

通过先进的质谱和分离技术，定量蛋白质组学可识别低丰度蛋白，并区分不同翻译后修饰状态，提高生物标志物研究的精准度。

3、动态变化监测

该技术可用于比较不同实验条件、时间点或组织状态下的蛋白质水平，为生物医学研究提供关键数据。

4、广泛的应用前景

定量蛋白质组学在疾病机制研究、新药开发、生物标志物发现、精准医学等多个领域具有广泛应用。

三、定量蛋白质组学的挑战

1、数据复杂性与重复性

由于样本的复杂性和数据分析方法的多样性，不同实验室间的数据重复性存在一定差异。

2、低丰度蛋白检测困难

体液或组织中的低丰度蛋白受高丰度蛋白的影响较大，需要额外的富集或去除高丰度蛋白的策略。

3、翻译后修饰（PTM）定量难度大

许多蛋白质翻译后修饰的丰度较低，且种类繁多，准确的鉴定和定量需要高分辨率质谱及优化的生物信息学工具。

4、标准化和数据整合问题

由于不同实验室的操作流程、质谱平台和分析方法存在差异，建立标准化的数据采集和分析流程仍是一个挑战。

百泰派克生物科技基于高通量质谱技术，构建了一系列符合CNAS/ISO9001双重质量体系认证的定量蛋白质组学分析平台，提供从样品制备、质谱检测到数据分析的一站式解决方案。我们的定量蛋白质组学服务涵盖：

• 标记定量（TMT、iTRAQ、SILAC等）及无标记定量（Label-free）
• 蛋白质相对定量、半定量及绝对定量分析
• 翻译后修饰蛋白组学分析（磷酸化、糖基化、泛素化等）
• 蛋白互作网络及通路富集分析

凭借丰富的经验和先进的平台，BTP可针对不同研究需求提供个性化方案，助力科研人员高效获取精准数据。欢迎联系我们，了解更多关于定量蛋白质组学的服务详情！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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